提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

够等级才能叫初雪 北京今天这场能算吗？******

　　已入三九，北京的初雪却迟迟未到，银装素裹的大北京何在？小伙伴们除了焦急还是焦急…不过今天大北京终于飘雪了，延庆、房山等部分地区已出现雪花纷飞的喜人景象，但能否迎来北京的初雪，我们一起来见证。

　　大家也许会疑惑，为啥上面说有些地方已经出现降雪，为什么我们还在说能否迎来北京初雪？实际上，气象上对北京初雪的定义，有一定的规则，必须达到一定的范围或强度才能算初雪。那咱们看看具体规则：

　　（1）全市20个人工站多于10个站点观测到有降雪现象。

　　（2）城区5站(朝阳、海淀、丰台、石景山、观象台)均观测到有降雪现象；（3）城区5站中的3个或以上站点观测到有降雪现象，且至少1个站降雪量≥0.1毫米。

　　满足以上条件之一，才认定为北京初雪。所以只有零星，或者某一地方降雪，可能还不算初雪。

　　让我们先看看最近3年的北京初雪日，可以发现都在11月份 。今年已经进入1月份中旬，还未看到初雪，难怪大家都着急了！

　　实际上，根据多年的统计数据，北京初雪日跨度很大，最早和最晚初雪日前五位排序见下表。早的初雪日出现在10月份，晚的出现在2月份。北京平均初雪日根据1981-2010年30年数据统计为11月29日。2022年北京初雪比平均初雪日已迟了一个多月。

　　好饭不怕晚，到底能否达到初雪标准，小伙伴们再耐心的等待一下，马上就会见分晓。据市气象台预报，受冷空气影响，13日至15日北京将出现寒潮天气。13日夜间开始至14日气温明显下降，白天最高气温在0~1℃之间，夜间最低气温在-9℃上下，前期暖融融的体感会消失殆尽；而在冷空气过后，气温持续低迷，所以小伙伴们在期待初雪的同时，出行及时添衣，注意防寒保暖，谨防感冒和心脑血管疾病的发生。

　　作者：杜传耀 北京市气象探测中心（北京市观象台）高级工程师